Подунай Ю.А.¹, Мартыненко Н.А.², Шкурина Н.А.³, Гумапак К.Р.С.⁴,
Гусев Е.С.²

Nikita A. Martynenko, Yuliia A. Podunay, Natalia A. Shkurina,
Evgeniy S. Gusev

¹Карадагская научная станция имени Т.И. Вяземского – природный заповедник РАН – филиал ФИЦ ИНБЮМ имени А.О. Ковалевского (Феодосия, Россия)
²Институт проблем экологии и эволюции имени А.Н. Северцова РАН – ИПЭЭ РАН
(Москва, Россия)
³Институт биологии внутренних вод имени И.Д. Папанина РАН – ИБВВ РАН
(Борок, Россия)
⁴Центральный университет Минданао (Мусуан, Марамаг, Филиппины)

УДК 582.261

Изучены бентосные и планктонные диатомовые водоросли водоемов о. Миндао (Филиппины). Обнаружено более 400 ОТЕ диатомовых водорослей с преобладанием шовных пеннатных диатомей. До уровня вида идентифицировано более 100 операциональных таксономических единиц. Проведено сравнение состава водотоков острова, а также таксономической структуры диатомовых водорослей различных субстратов.

Ключевые слова: диатомовые водоросли; половое воспроизведение; соленость; освещенность

Диатомовые водоросли считаются важными биоиндикаторами для мониторинга экологического состояния водоемов из-за их чувствительности к физико-химическим стрессорам и широкого распространения (Vasselon et al., 2017). Их способность адаптироваться к различным условиям существования, включая достаточно экстремальные, делает диатомовые пригодными для разнообразных применений. Традиционный мониторинг качества окружающей среды, оценка биоразнообразия диатомей часто опираются на морфологическую идентификацию, которая отнимает много времени и требует высокого уровня таксономической экспертизы (Mauvisseau et al., 2019). Однако молекулярная таксономия, поддерживаемая ДНК-метабаркодированием, предлагает новый подход к мониторингу окружающей среды и может улучшить оценку биоразнообразия и изменений в структуре сообществ. ДНК-метабаркодирование доказало свою эффективность в оценке экологического состояния, раннем обнаружении инвазивных видов и точной оценке морского бентоса и планктона (Perez-Burillo et al., 2022). Цель данного исследования – оценка разнообразия диатомовых водорослей водотоков и водоёмов острова Минданао, Филиппины. Для этого были изучены водные объекты 3-х охраняемых природных территорий острова и несколько рек в районах с интенсивной антропогенной нагрузкой.

В провинции Букиднон, в пределах территории национального парка Китанглад изучены две реки, а также исследованы две реки, берущие начало в этом лесном массиве. В ходе работ отобраны пробы в водотоках хребта Panimahawa (CEDAR). Для исследований были выбраны 3 реки, 10 источников (ключей), берущих начало в горном массиве, а также 1 болотный массив и несколько небольших водоёмов среди камней. Также были изучены ручьи в районе распространения карста в пределах района Марилог, Давао. Всего в ходе работ собрано для анализа методом метабаркодинга 42 бентосных и 9 планктонных проб. Для изучения использовали секвенирование тотальной ДНК (IlluminaMiSeq, 2×300 п.н.), в качестве генетического маркера был выбран регион rbcL cpDNA. Биоинформатический анализ проводили в QIIME2 инструментами DADA2. Для классификации использовали базы данных Diat.barcode и GenBank. Операциональные таксономические единицы (ОТЕ) группировали при уровне сходства 97%. ОТЕ с числом чтений менее 5 удалялись.

В изученных водоемах о. Миндао было обнаружено более 400 ОТЕ диатомовых водорослей с преобладанием шовных пеннатных диатомей – представителей 9 порядков и более 40 родов Bacillariophyceae. Наиболее богатыми по числу видов были роды Nitzschia, Pinnularia, Cymbella, Navicula, Diadesmis, Sellaphora, Encyonema, Gomphonema, Achnanthidium и др. Среди бесшовных пеннатных наиболее встречаемыми в пробах были представители рода Ulnaria. Центрические диатомеи представлены родами Melosira, Thalassiosira и Hyalodiscus. Использование классификатора Diat.barcode и базы данных нуклеотидных последовательностей GenBank позволило идентифицировать больше 100 организмов до уровня вида и большинство оставшихся до рода. Проведено сравнение состава водотоков острова, а также таксономической структуры диатомовых водорослей различных субстратов.

Финансирование. Исследование выполнено при финансовой поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации в рамках Соглашения № 075-15-2023-600.

Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов, требующего раскрытия в данной статье.

Список литературы

1. Mauvisseau Q., Burian A., Gibson C., Brys R., Ramsey A., Sweet M. Influence of accuracy, repeatability and detection probability in the reliability of species-specific eDNA based approaches // Scientific Reports. 2019. V.9 (1). ID 580. DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-018-37001-y
2. Pérez-Burillo J., Valoti G., Witkowski A., Prado P., Mann D.G., Trobajo R. Assessment of marine benthic diatom communities: Insights from a combined morphological–metabarcoding approach in Mediterranean shallow coastal waters // Marine Pollution Bulletin. 2022. V.174. ID 113183. DOI: https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2021.113183
3. Vasselon V., Rimet F., Tapolczai K., Bouchez A. Assessing ecological status with diatoms DNA metabarcoding: Scaling-up on a WFD monitoring network (Mayotte Island, France) // Ecological Indicators. 2017. V.82. P. 1–12. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2017.06.024

Статья поступила в редакцию 18.06.2025
После доработки 08.08.2025
Статья принята к публикации 28.08.2025

Об авторах

Подунай Юлия Александровна – Yuliia A. Podunay

кандидат биологических наук
старший научный сотрудник, Карадагская научная станция имени Т.И. Вяземского – природный заповедник РАН – филиал ФИЦ ИНБЮМ им. А.О. Ковалевского, Феодосия, Россия (Vyazemsky Karadag Scientific Station of Kovalevskii Institute of Biology of the Southern Seas, RAS, Russia, Feodosia)

grab-ua@yandex.ru

Мартыненко Никита Александрович – Nikita A. Martynenko

младший научный сотрудник, Институт проблем экологии и эволюции им. Н.А. Северцова РАН. Россия, Москва (Severtsov Institute of Ecology and Evolution, RAS, Russia, Moscow)

nikita-martynenko@yandex.ru

Шкурина Наталия Александровна – Natalia A. Shkurina

научный сотрудник, Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН, Россия, пос. Борок (Papanin Institute for Biology of Inland Waters, RAS, Russia, Borok)

shkurrr@yandex.ru

Гумапак Кайла Роза – Kyla Rose S Gumapac

Центральный университет Минданао, Филиппины, Мусуан (Central Mindanao University, Philippines, Musuan)

kylarosesalguerogumapac@gmail.com

Гусев Евгений Сергеевич – Evgeniy S. Gusev

кандидат биологических наук
старший научный сотрудник, Институт проблем экологии и эволюции им. Н.А. Северцова РАН. Россия, Москва (Severtsov Institute of Ecology and Evolution, RAS, Russia, Moscow)

algogus@yandex.ru

Корреспондентский адрес: Россия, 298188, Феодосия, пос. Курортное, ул. Науки, д. 24, КНС-ПЗ РАН – филиал ФИЦ ИнБЮМ, тел. (36562) 26-212.

ССЫЛКА:

Подунай Ю.А., Мартыненко Н.А., Шкурина Н.А., Гумапак К.Р.С., Гусев Е.С. Разнообразие диатомовых водорослей речных систем о. Минданао (Филиппины) // Вопросы современной альгологии. 2025. № 1–2(37–38). С. 143–145. URL: http://algology.ru/2154

DOI – https://doi.org/10.33624/2311-0147-2025-1(37)-143-145

EDN – GPIGGY

При перепечатке ссылка на сайт обязательна

Уважаемые коллеги! Если Вы хотите получить версию статьи в формате PDF, пожалуйста, напишите в редакцию, и мы ее вам с удовольствием пришлем бесплатно. 
Адрес - info@algology.ru

Diversity of diatoms in river systems of Mindanao Island

Yuliia A. Podunay¹, Nikita A. Martynenko², Natalia A. Shkurina³,
Kyla Rose S. Gumapac⁴, Evgeniy S. Gusev¹

¹Vyazemsky Karadag Scientific Station of Kovalevsky Institute of Biology of the Southern Seas, RAS (Feodosia, Russia)
²Severtsov Institute of Ecology and Evolution, RAS (Moscow, Russia)
³Papanin Institute for Biology of Inland Waters, RAS (Borok, Russia)
⁴Central Mindanao University (Musuan, Philippines)

Benthic and planktonic diatoms of the water bodies of Mindao Island (Philippines) were studied. More than 400 OTUs of diatoms were found, with raphe pennate diatoms predominating. More than 100 operational taxonomic units were identified to the species level. A comparison was made of the composition of the island's watercourses, as well as the taxonomic structure of diatoms of various substrates.

Key words: Diatoms; biodiversity; metabarcoding; Philippines

References

1. Mauvisseau Q., Burian A., Gibson C., Brys R., Ramsey A., Sweet M. Influence of accuracy, repeatability and detection probability in the reliability of species-specific eDNA based approaches. Scientific Reports. 2019. V.9 (1). ID 580. DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-018-37001-y
2. Pérez-Burillo J., Valoti G., Witkowski A., Prado P., Mann D.G., Trobajo R. Assessment of marine benthic diatom communities: Insights from a combined morphological–metabarcoding approach in Mediterranean shallow coastal waters. Marine Pollution Bulletin. 2022. V.174. ID 113183. DOI: https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2021.113183
3. Vasselon V., Rimet F., Tapolczai K., Bouchez A. Assessing ecological status with diatoms DNA metabarcoding: Scaling-up on a WFD monitoring network (Mayotte Island, France). Ecological Indicators. 2017. V.82. P. 1–12. DOI: https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2017.06.024.

Authors

Podunay Yuliia A. 

ORCID - https://orcid.org/0000-0002-0519-2908, eLIBRARY SPIN-код - 6730-1070.

Vyazemsky Karadag Scientific Station of Kovalevskii Institute of Biology of the Southern Seas, RAS, Feodosia, Russia

grab-ua@yandex.ru

Martynenko Nikita A.

ORCID - https://orcid.org/0000-0002-7286-003X, eLIBRARY SPIN-код - 3617-7004.

Severtsov Institute of Ecology and Evolution, RAS, Moscow, Russia

nikita-martynenko@yandex.ru

Shkurina Natalia A.

ORCID – http://orcid.org/0000-0001-8044-2017

Papanin Institute for Biology of Inland Waters, RAS, Borok, Russia

shkurrr@yandex.ru

Gumapac Kyla Rose S.

ORCID – https://orcid.org/0009-0008-8147-5820

Central Mindanao University, Musuan, Philippines

kylarosesalguerogumapac@gmail.com

Gusev Evgeniy S.

ORCID – https://orcid.org/0000-0002-7397-5808, eLIBRARY SPIN-код - 1473-0676.

Severtsov Institute of Ecology and Evolution, RAS, Moscow, Russia

algogus@yandex.ru

ARTICLE LINK:

Podunay Yu.A., Martynenko N.A., Shkurina N.A., Gumapac K.R.S., Gusev E.S. Diversity of diatoms in river systems of Mindanao Island. Voprosy sovremennoi algologii (Issues of modern algology). 2025. № 1–2(37–38). С. 143–145. URL: http://algology.ru/2154

DOI – https://doi.org/10.33624/2311-0147-2025-1(37)-143-145

EDN – GPIGGY

When reprinting a link to the site is required

Dear colleagues! If you want to receive the version of the article in PDF format, write to the editor, please and we send it to you with pleasure for free. 
Address - info@algology.ru

На ГЛАВНУЮ

Карта сайта

КОНТАКТЫ

Email: info@algology.ru

Изготовление интернет сайта
5Dmedia

ЛИЦЕНЗИЯ

Эл N ФС 77-22222 от 01 ноября 2005г.

ISSN 2311-0147