|
 |
|
по Материалам XVI Международной научной конференции диатомологов «Диатомовые водоросли: морфология, систематика, флористика, экология, палеогеография, биостратиграфия», посвященной 90-летию со дня рождения З.И. Глезер 19 - 24 августа 2019 г. Филогения и морфология некоторых видов рода Gomphonema Ehrenberg
Кезля Е.М., Мальцев Е.И., Глущенко А.М., Куликовский М.С. Elena M. Kezlya, Yevhen I. Maltsev, Anton M. Glushchenko,
Институт физиологии растений имени К.А. Тимирязева РАН (Москва, Россия) УДК 582.261.5
Анализируются новые данные по молекулярно-генетическому изучению диатомовых водорослей рода Gomphonema Ehrenberg из разных регионов земного шара. Ключевые слова: диатомовые водоросли; молекулярные методы; Gomphonema.
Одним из крупнейших родов в семействе Gomphonemataceae является род Gomphonema Ehrenberg, который характеризуется гетерополярной симметрией, центральным положением шва, наличием поровых полей в нижней части створки. Отличительной особенностью рода являются однорядные штрихи (редко двухрядные), состоящие из пороидов, закрытых с наружной стороны волой, образующей лишь небольшую с-образную щель, либо округлыми пороидами, с наличием внутри них небольших выростов (Куликовский и др., 2016). Стигма часто присутствует. В тоже время именно этот род отличается от других родов семейства очень большим разнообразием. Морфология многих таксонов не является одинаковой. Ранее в этот род включались все таксоны с гетерополярной симметрией. В работе рассматриваются новые данные по морфологическому и молекулярно-генетическому изучению представителей этого рода из водоемов Москвы, Вьетнама, Эфиопии и других регионов. В нашем исследовании изменчивости молекулярных маркеров штрих-кода на примере области V4 SSU проанализировано 48 нуклеотидных последовательностей, представляющих 48 моноклональных штаммов диатомовых водорослей из рода Gomphonema. Все штаммы выделены из достаточно удаленных друг от друга пресноводных экосистем как на территории России (оз. Байкал, Карелия, Алтай), так и за ее пределами (Вьетнам, Индонезия, Монголия и Эфиопия). Также в анализ были включены уже депонированные в GenBank последовательности области V4 SSU таких видов Gomphonema как G. acuminatum (KJ011671), G. affine (HQ912608), G. angustatum (KJ011652), G. brebissonii (KJ011653), G. carolinense (KJ011654), G. dichotomum (KJ011655), G. gracile (KJ011656), G. intricatum (KJ011657), G. parvulum (HQ912595), G. pumilum (KC736629) и G. subclavatum (KJ011666). У исследованных штаммов длина области V4 SSU составила 225–227 п.н. Внутри выравнивания оказалось 53 вариабельных нуклеотидных позиции (23% от всей длины области V4 SSU), при этом последовательности известных видов из GenBank отличались лишь 39 позициях. Не укорененное Байесовское филогенетическое дерево, построенное на основе полученного выравнивания V4 SSU, показало наличие не менее 35 отличающихся филогенетических линий внутри рода Gomphonema, представленных как одним, так и несколькими штаммами. Следует отметить, что близкие штаммы не всегда соответствовали одному географическому региону. Нами обнаружены клады, в которые вошли представители из географически менее отдаленных районов, например, разных островов Индонезии (штаммы ind95, ind96 и ind302), оз. Байкал и Монголии (mnp151 и B351; B691 и mnp78). Также присутствуют клады, представляющие достаточно отдаленные территории: Карелию и Эфиопию (штаммы ka12 и ef10), Карелию и Монголию (mnp105 и ka10), оз. Байкал и Вьетнам (B300 и VN322). В целом, обнаруженные вариабельные позиции внутри области V4 SSU, приводящие к обособлению отдельных филогенетических линий внутри рода Gomphonema, свидетельствуют о том, что выделенные нами новые штаммы могут быть ранее генетически неизученными уже известными видами или представлять новые линии в Gomphonema.
Работа выполнена в рамках грантов РФФИ 17-04-00042-а и 19-34-70016-мол_а_мос. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов, требующего раскрытия в данном сообщении.
Список литературы
Статья поступила в редакцию 1.06.2019
Об авторах Кезля Елена Михайловна – Elena M. Kezlya кандидат биологических наук melosira@mail.ru Мальцев Евгений Иванович – Yevhen I. Maltsev кандидат биологических наук ye.maltsev@gmail.com Глущенко Антон Михайлович – Anton M. Glushchenko научный сотрудник, Институт физиологии растений имени. К.А. Тимирязева РАН, Москва, Россия (Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia) chelovek91_91@mail.ru Куликовский Максим Сергеевич – Maxim S. Kulikovskiy доктор биологических наук max-kulikovsky@yandex.ru Корреспондентский адрес: Россия, 127276, г. Москва, Ботаническая ул., 35, ИФР РАН. Телефон (499)678-54-00.
ССЫЛКА: Кезля Е.М., Мальцев Е.И., Глущенко А.М., Куликовский М.С. Филогения и морфология некоторых видов рода Gomphonema Ehrenberg // Вопросы современной альгологии. 2019. № 2 (20). С. 181–183. URL: http://algology.ru/1525 DOI – https://doi.org/10.33624/2311-0147-2019-2(20)-181-183
При перепечатке ссылка на сайт обязательна
Phylogeny and morphology of some species from the genus Gomphonema Ehrenberg Elena M. Kezlya, Yevhen I. Maltsev, Anton M. Glushchenko, Maxim S. Kulikovskiy Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS (Moscow, Russia) New molecular data on diatoms from the genus Gomphonema Ehrenberg are analyzed. Key words: diatoms; molecular data; Gomphonema.
References
Authors Kezlya Elena M. Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia melosira@mail.ru Maltsev Yevhen I. ORCID – https://orcid.org/0000-0003-4710-319X, eLIBRARY AuthorID – 745467 Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia ye.maltsev@gmail.com Glushchenko Anton M. ORCID – https://orcid.org/0000-0002-3876-3455 Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia chelovek91_91@mail.ru Kulikovskiy Maxim S. ORCID – https://orcid.org/0000-0003-0999-9669 Timiryazev Institute of Plant Physiology RAS, Moscow, Russia max-kulikovsky@yandex.ru
ARTICLE LINK: Kezlya E.M., Maltsev Ye.I., Glushchenko A.M., Kulikovskiy M.S. Phylogeny and morphology of some species from the genus Gomphonema Ehrenberg. Voprosy sovremennoi algologii (Issues of modern algology). 2019. № 2 (20). P. 181–183. URL: http://algology.ru/1525 DOI – https://doi.org/10.33624/2311-0147-2019-2(20)-181-183 When reprinting a link to the site is required
Уважаемые коллеги! Если Вы хотите получить версию статьи в формате PDF, пожалуйста, напишите в редакцию, и мы ее вам с удовольствием пришлем бесплатно.
На ГЛАВНУЮ
|
|
|
 | | ||
|
| ||